上海中医药大学学报是由上海中医药大学;上海市中医药研究院主办、国内外公开发行的学术期刊，国内统一连续出版物号为31-1788/R，国际标准连续出版物号为1008-861X，出版周期为双月刊，长期聚焦自然科学与工程技术、医药卫生科技、中医学等前沿动态与实践创新，重点刊发原创性研究论文、综述报告、案例分析及教学方法探讨等成果。
上海中医药大学学报一级发文领域广泛涵盖医药卫生、文化科学、语言文字、历史地理、农业科学、理学、经济管理、化学工程、自动化与计算机技术、哲学宗教等学科门类，主要刊载这些领域下的基础理论、应用研究与前沿交叉成果。为进一步明确收稿方向，本刊基于近年来的发文量与学术被引表现，在二级发文层面上重点关注但不限于以下具体方向：医药卫生 / 中医学、医药卫生 / 中药学、医药卫生 / 中西医结合、医药卫生 / 临床医学、医药卫生 / 中医临床基础、医药卫生 / 中医内科学、医药卫生 / 针灸推拿学、医药卫生 / 中医基础理论、文化科学 / 教育学、医药卫生 / 内科学。投稿文章须属于上述一级发文领域中的任一学科，并且研究主题明确归属于所列二级方向之一，或与之紧密相关。对于明显偏离上述一级领域或二级方向的稿件，编辑部将作退稿或建议转投处理。本刊鼓励作者在投稿前仔细比对自己的研究主题是否与上述高发文量、高被引量的方向相契合，以提升稿件送审与录用的效率。
上海中医药大学学报主要资助课题包括：上海市教育委员会重点学科基金(J50301)、上海市教育委员会重点学科基金(T0305)、上海市教育委员会重点学科基金(S30301)、上海市教育委员会重点学科基金(T0304)、上海市教育委员会重点学科基金(Y0302)、国家自然科学基金(81373619)、上海市教育委员会重点学科基金(T0302)、国家自然科学基金(30271615)、上海市教育委员会重点学科基金(Y0301)、上海市教育委员会重点学科基金(T0303)。欢迎具有理论深度、实证支撑或交叉学科视角的稿件。投稿时请注意：稿件必须为未公开发表的原创作品，杜绝抄袭、剽窃等学术不端行为；严禁一稿多投，一经发现将立即退稿。上海中医药大学学报全体编辑同仁期待海内外学者不吝赐稿，共同推动医药卫生科技行业领域的学术繁荣与创新发展。